Trung tâm Nhiệt đới Việt-Nga thông tin, cho đến nay, đã ghi nhận được tổng số 444 loài san hô khác nhau ở vùng biển Việt Nam, trong đó có 378 loài san hô cứng. Tuy nhiên, có một tình trạng xuống cấp đáng báo động đang diễn ra trên toàn quốc.

Theo đó, kết quả nghiên cứu do Trung tâm Nhiệt đới Việt – Nga thực hiện về hiện trạng các rạn san hô trong nước cho thấy so với những nghiên cứu trước năm 2010, các rạn san hô hiện nay đang có xu hướng giảm đáng báo động. Trình độ của họ đã giảm từ xếp hạng phát triển trung bình xuống kém phát triển.
San hô đang chết hàng loạt ở nhiều vùng như Cát Bà, Lý Sơn, Nam chưa, Cô Tô (những nơi có tình trạng nghiêm trọng nhất).
Điều này có nghĩa là xu hướng suy thoái rạn san hô đã diễn ra trên khắp các vùng biển Việt Nam, từ Bắc vào Nam.
Nhìn chung, ngay cả trong các khu bảo tồn biển (KBTB), tình trạng suy giảm rạn san hô không hề ít đáng lo ngại, với mức giảm 0,72% mỗi năm.